A kamerák egyik lényeges tulajdonsága a felbontás, vagyis a megapixelek száma, bár ez a mikroszkóp-kamerát jellemző sok paraméter közül az egyik.
A kamera kiválasztásakor figyeljünk oda milyen mikroszkóp-csatlakozási lehetőséggel rendelkezik (23.2 mm, c-mount), mivel valamiféle adapter szükséges lehet a mikroszkópra történő illesztés során.