Mivel alulról világítják át a tárgyakat, ezért vékony metszeteket kell készíteni, mely kisebb gyermekek számára bonyolult művelet lehet. Természetesen készen is vehetünk mikroszkóp-preparátumokat.
A binokuláris ill. trinokuláris mikroszkópok kényelmesebben használhatóak hosszabb időn keresztül is. A mikroszkóp kamerát bármelyik változat képes fogadni.